Ректора бира Савет Универзитета у Новом Саду на мандатни период од три године из реда редовних професора факултета у саставу Универзитета.
Универзитет има четири проректора. Проректоре бира Савет Универзитета на предлог Ректора на мандатни период од три године из реда професора факултета у саставу Универзитета.

Ректор Универзитета у Новом Саду је др Дејан Јакшић, редовни професор Економског факултета.

Проректор за наставу је др Сања Подунавац-Кузмановић, редовни професор Технолошког факултета.

Проректор за науку је др Стеван Станковски, редовни професор Факултета техничких наука.

Проректор за међународну сарадњу је др Дејан Мадић, редовни професор Факултета спорта и физичког васпитања.

Проректор за финансије и организацију је др Владислав Зекић, редовни професор Пољопривредног факултета.